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1984 年英國(guó)萊斯特大學(xué)的遺傳學(xué)家 Jefferys 及其合作者首次將分離的人源小衛(wèi)星 DNA 用作基因探針，與人基因組酶切片段進(jìn)行 Southern 雜交，獲得了由多個(gè)位點(diǎn)上的等位基因組成的長(zhǎng)度不等的雜交帶圖紋，這種圖紋極少有兩個(gè)人完全相同，故稱為"DNA 指紋"。意思是它同人的指紋一樣是每個(gè)人所特有的。眾多「DNA 指紋」組成「DNA 指紋圖譜」。

DNA 指紋的圖像在 X 光膠片中呈一系列條紋，很像商品上的條形碼。DNA 指紋圖譜，開創(chuàng)了檢測(cè) DNA 多態(tài)性（生物的不同個(gè)體或不同種群在 DNA 結(jié)構(gòu)上存在著差異）的多種多樣的手段，如 RFLP（限制性內(nèi)切酶酶切片段長(zhǎng)度多態(tài)性）分析、串聯(lián)重復(fù)序列分析、RAPD（隨機(jī)擴(kuò)增多態(tài)性 DNA）分析等等。各種分析方法均以 DNA 的多態(tài)性為基礎(chǔ)，產(chǎn)生具有高度個(gè)體特異性的 DNA 指紋圖譜，由于 DNA 指紋圖譜具有高度的變異性和穩(wěn)定的遺傳性，且仍按簡(jiǎn)單的孟德爾方式遺傳，成為目前最具吸引力的遺傳標(biāo)記。

DNA 指紋圖譜的高變異性和體細(xì)胞穩(wěn)定性可用于鑒定個(gè)體，這對(duì)法醫(yī)學(xué)上鑒別犯罪分子和確定個(gè)體間的血緣關(guān)系極有價(jià)值。它在人類醫(yī)學(xué)中被用于個(gè)體鑒別、確定親緣關(guān)系、醫(yī)學(xué)診斷及尋找與疾病連鎖的遺傳標(biāo)記；在動(dòng)物進(jìn)化學(xué)中可用于探明動(dòng)物種群的起源及進(jìn)化過程；在物種分類中，可用于區(qū)分不同物種，也有區(qū)分同一物種不同品系的潛力。在作物的基因定位及育種上也有非常廣泛的應(yīng)用。

DNA 指紋圖譜法的基本操作：從生物樣品中提取 DNA（DNA 一般都有部分的降解），可運(yùn)用 PCR 技術(shù)擴(kuò)增出高可變位點(diǎn)（如 VNTR 系統(tǒng)，串聯(lián)重復(fù)的小衛(wèi)星 DNA 等）或者完整的基因組 DNA，然后將擴(kuò)增出的 DNA 酶切成 DNA 片斷，經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳，按分子量大小分離后，轉(zhuǎn)移至尼龍濾膜上，然后將已標(biāo)記的小衛(wèi)星 DNA 探針與膜上具有互補(bǔ)堿基序列的 DNA 片段雜交，用放射自顯影便可獲得 DNA 指紋圖譜。

使用瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè) DNA 指紋圖譜分析中的酶切產(chǎn)物存在著眾多不便，需要手工配膠、制膠，加入的染料毒性較大，嚴(yán)重危害人體健康，同時(shí)需要使用大量耗材，還需要搭配凝膠成像系統(tǒng)進(jìn)行拍照及數(shù)據(jù)的保留，后期再進(jìn)行數(shù)據(jù)的處理，費(fèi)時(shí)費(fèi)力。厚澤生物公司推出 Qsep 系列毛細(xì)管電泳儀來實(shí)現(xiàn)自動(dòng)化電泳過程，為科研工作者提供更為方便快捷的科研服務(wù)。Qsep 系列毛細(xì)管電泳儀也稱為全自動(dòng)核酸蛋白分析系統(tǒng)，只需要實(shí)驗(yàn)人員將 PCR 產(chǎn)物或酶切產(chǎn)物放置于儀器載物臺(tái)上，選擇所需要的程序，即可在電腦上得出實(shí)驗(yàn)結(jié)果，結(jié)果以數(shù)字峰形圖和模擬凝膠圖呈現(xiàn)，數(shù)據(jù)分析方法簡(jiǎn)單，且成本極低，分辨率很高，500bp 之內(nèi)可達(dá)到 1% 分辨率，適用于各種分子標(biāo)記。